Von Montag bis Freitag gibt es Fahrplanänderungen am Abend und in der Nacht, samstags und sonntags ganztags. 

• Montags bis freitags beginnt der 20-Minuten-Takt auf den Linien U1 und U2 bereits ab 22.30 Uhr.
• An den Wochenenden ergeben sich folgende Änderungen: 
  • die Linie U1 Süd fährt nur zwischen Kolumbusplatz und Mangfallplatz, die U2 ist am Hauptbahnhof unterbrochen. Fahrgäste der U2 müssen in beiden Fahrtrichtungen jeweils über das Zwischengeschoss umsteigen.
  • In den nördlichen Streckenabschnitten (U1: zwischen Olympia-Einkaufszentrum und Hauptbahnhof; U2: zwischen Feldmoching und Hauptbahnhof) fährt alle zehn Minuten ein Zug, auf den südlichen Abschnitten (U1: zwischen Mangfallplatz und Hauptbahnhof; U2: zwischen Messestadt Ost und Hauptbahnhof) alle zwölf Minuten.
  • An den Bahnhöfen Stiglmaierplatz, Hauptbahnhof, Sendlinger Tor und Fraunhoferstraße fahren die Züge teilweise in beiden Richtungen vom selben Gleis ab.
  • Aufgrund der Baumaßnahmen ist die Linie U8 ist an Samstagen nicht in Betrieb. Fahrgäste können auf die Linien U2, U3 und U5 ausweichen.

Die Fahrplanänderungen gelten allesamt nicht in der Woche der IAA vom 6. September bis 12. September.