In der Regel ist der Betrieb dadurch zu folgenden Zeiten eingeschränkt:

• an den Wochenenden samstags ab etwa 21 Uhr sowie sonntags ganztags
• unter der Woche von Montag bis Donnerstag ab etwa 22.30 Uhr bis Betriebsschluss
• Ausgenommen sind drei Wochenenden, an denen der Betrieb jeweils nur an einem Tag ab etwa 22.30 Uhr eingeschränkt ist (Samstag, 15. Oktober Einschränkungen ab 22.30 Uhr / Sonntag, 16. Oktober keine Einschränkungen; Samstag, 22. Oktober keine Einschränkungen / Sonntag, 23. Oktober Einschränkungen ab 22.30 Uhr; Samstag, 12. November: keine Einschränkungen / Sonntag 13. November Einschränkungen ab 22.30 Uhr) 

Während der Unterbrechung gestaltet sich der Betrieb wie folgt:

• Im Abschnitt Odeonsplatz – Marienplatz – Sendlinger Tor – Goetheplatz fährt ein Pendelzug im 15-Minuten-Takt.
• Die U3 ist zwischen Münchner Freiheit und Goetheplatz unterbrochen. Zwischen Moosach und Münchner Freiheit fährt sie im 10-Minuten-Takt, zwischen Goetheplatz und Fürstenried West alle 15 Minuten. Die gewohnten Busanschlüsse können teilweise nicht erreicht werden.
• Die U6 ist zwischen Odeonsplatz und Implerstraße unterbrochen. Sie fährt zwischen Garching-Forschungszentrum beziehungsweise Fröttmaning und Odeonsplatz sowie zwischen Implerstraße und Klinikum Großhadern im 10-Minuten-Takt.

Am kommenden Wochenende (8. und 9. Oktober) wird der Abschnitt Münchner Freiheit bis Odeonsplatz ausnahmsweise von der U3 statt von der U6 bedient. Die U6 endet an diesem Wochenende von Garching-Forschungszentrum kommend bereits an der Münchner Freiheit.