Die Sperrungen führen zu unterschiedlich starken Auswirkungen je nach Tageszeit und Streckenabschnitt der Stammstrecke. Alle Auswirkungen sind in vier Betriebskonzepten zusammengefasst, die jeweils für einen Vormittag oder einen Nachmittag gelten. Sie können die Betriebskonzepte auf der Seite der Deutschen Bahn abrufen (Link in der gelben Infobox).

Darüber hinaus gilt:

• Die insgesamt 4 Betriebskonzepte für beide Tage wechseln jeweils um 13 beziehungsweise um 14 Uhr.
• Am Samstag zwischen 6 und 13 Uhr ist kein S-Bahnverkehr am Ostbahnhof möglich, deshalb ist ein Schienenersatzverkehr zwischen Isartor und Ostbahnhof (Busbahnhof) eingerichtet.
• Einzelheiten entnehmen Sie bitte den entsprechenden Plakaten.
• Wegen anderer Bauarbeiten besteht auf der S 8 Richtung Flughafen Schienenersatzverkehr zwischen Ostbahnhof (Friedenstraße) und Ismaning.

Grund für die Baustelle an der Stammstrecke: Am Ostbahnhof werden mit einem Hubschrauber neue Signale für das elektronische Stellwerk aufgestellt.